研究中复用
ncbi.nlm.nih.gov提供第三方比较分析所用的肝细胞癌单细胞RNA测序数据，并依据原始文献重新聚类和注释细胞类型。
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提供第三方比较分析所用的肝细胞癌单细胞RNA测序数据，并依据原始文献重新聚类和注释细胞类型。
提供大型示例2中的脂肪组织AnnData输入，参与Tabula Sapiens跨组织单细胞整合演示。
作为诊断可靠性筛选中被排除的样本提及，未纳入最终分析。
OCELOT数据被复用于GPFM预训练。
提供以供体年龄为时间标签的腺泡细胞单细胞转录组数据，作为公共数据用于Sceptic伪时间推断和方法性能比较。
作为报告摘要中列出的DHMC LUAD公共数据入口，用于本研究下游基准评估。
该截断链接所在引文指向SIIM-ACR气胸数据，本文将其用于胸片疾病分类评估。
TCGA-LIHC 公共病理数据用于本文半监督模型的组织分类基准评测，比较归一化 H&E 图像上不同弱监督与监督方法的性能；不是作者自建的结直肠癌肝转移队列。
提供LYON挑战的CD3/CD8免疫组化淋巴细胞检测数据；本研究使用其中441个测试区域，评估DeepLIIF对跨机构图像及组织、染色伪影的适应能力。
PRJNA549884存放本文RNA测序数据，支撑Wnt抑制、FAXDC2和肿瘤细胞分化相关的基因表达分析。
综述通过该研究介绍C1Q阳性巨噬细胞样白血病细胞，以及C1Q与不良预后、成纤维细胞通讯和肿瘤浸润通路的关系。
研究从该外部资源下载卵巢癌腹水单细胞数据；腹水数据用于构建Scaden对比模型的训练集，并比较其在匹配及不匹配测试数据上的表现。
复用GSE4412的转录组表达谱和临床数据，用于验证研究结论并补充分析；其GPL96和GPL97平台数据按平台去除批次效应并纳入相应合并队列。
对应GEO184398-Live整体RNA测序文件，用于DeSide细胞比例预测的外部评估，与流式分数比较。
作为从GEO获取的补充数据集，用于跨数据集验证研究结果、评估结果的可靠性。
作为单细胞语言模型参考入口，提供scGPT预训练模型和细胞注释相关网站；正文以其说明整合基因表达、染色质可及性和蛋白丰度的跨模态微调。
cBioPortal的lung_msk_mind_2020队列展示本文患者的基因组特征，作为与CT和PD-L1病理特征联合预测免疫治疗反应的基因组数据入口。
提供大型示例2中的血液AnnData输入，参与Tabula Sapiens跨组织单细胞整合演示。
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