实验结果报告
BCSS 组织区域分割与分类
已完成。本报告汇集本次运行已生成的结果、图表与待补充事项。
运行概况
| 步骤 | 执行状态 |
|---|---|
| reuse_verified | 已完成 |
| evaluate | 已完成 |
指标保留输出中的名称与数值。未提供的真值、对照实验与外部验证不推断为已完成。
关键结果与指标
| 指标 / 项目 | 结果 |
|---|---|
| test_patient | TCGA-A2-A04Q-DX1 |
| valid_pixels | 517346 |
| ignored_pixels | 70942 |
| pixel_accuracy | 0.502712 |
| macro_IoU_supported | 0.291321 |
| macro_IoU_union_present | 0.218491 |
| classes | [{"class_id": 1, "class": "Tumor", "truth_pixels": 134127, "predicted_valid_pixels": 148005, "IoU": 0.4361809352188388, "Dice": 0.607417804431968}, {"class_id": 2, "class": "Stroma", "truth_pixels": 5178, "predicted_valid_pixels": 0, "IoU": 0.0, "Dice": 0.0}, {"class_id": 3, "class": "Lymphocytic infiltrate", "truth_pixels": 378041, "predicted_valid_pixels": 194698, "IoU": 0.43778194497789624, "Dice": 0.6089684830262999}, {"class_id": 4, "class": "Necrosis/debris", "truth_pixels": 0, "predicted_valid_pixels…(摘录,完整内容见原文件) |
| evaluation_scope | explicit polygons only; all predictions in valid pixels included; no test-driven selection |
结果图谱
显示副本;原始输出保留在结果文件夹。
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数据与统计
area.csv
分析 5 行
| 字段 | 有效值 | 均值 | 中位数 | 最小值 | 最大值 |
|---|---|---|---|---|---|
| predicted_pixels | 5 | 117658 | 169969 | 0 | 219023 |
| image_fraction | 5 | 0.2 | 0.288921 | 0 | 0.372306 |
原始数据摘录 · 前 8 行,最多 12 列
| class_id | class | predicted_pixels | image_fraction |
|---|---|---|---|
| 1 | Tumor | 169969 | 0.28892141264142734 |
| 2 | Stroma | 0 | 0.0 |
| 3 | Lymphocytic infiltrate | 199296 | 0.3387728459530026 |
| 4 | Necrosis/debris | 219023 | 0.37230574140557005 |
| 9 | Fat | 0 | 0.0 |
confusion.csv
分析 5 行
| 字段 | 有效值 | 均值 | 中位数 | 最小值 | 最大值 |
|---|---|---|---|---|---|
| Tumor | 5 | 29601 | 1572 | 0 | 85686 |
| Stroma | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Lymphocytic infiltrate | 5 | 38939.6 | 134 | 0 | 174390 |
| Necrosis/debris | 5 | 34928.6 | 3472 | 0 | 142904 |
| Fat | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 |
原始数据摘录 · 前 8 行,最多 12 列
| Tumor | Stroma | Lymphocytic infiltrate | Necrosis/debris | Fat | |
|---|---|---|---|---|---|
| Tumor | 85686 | 0 | 20174 | 28267 | 0 |
| Stroma | 1572 | 0 | 134 | 3472 | 0 |
| Lymphocytic infiltrate | 60747 | 0 | 174390 | 142904 | 0 |
| Necrosis/debris | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Fat | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
metrics.csv
分析 5 行
| 字段 | 有效值 | 均值 | 中位数 | 最小值 | 最大值 |
|---|---|---|---|---|---|
| truth_pixels | 5 | 103469 | 5178 | 0 | 378041 |
| predicted_valid_pixels | 5 | 103469 | 148005 | 0 | 194698 |
| IoU | 4 | 0.218491 | 0.21809 | 0 | 0.437782 |
| Dice | 4 | 0.304097 | 0.303709 | 0 | 0.608968 |
原始数据摘录 · 前 8 行,最多 12 列
| class_id | class | truth_pixels | predicted_valid_pixels | IoU | Dice |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Tumor | 134127 | 148005 | 0.4361809352188388 | 0.607417804431968 |
| 2 | Stroma | 5178 | 0 | 0.0 | 0.0 |
| 3 | Lymphocytic infiltrate | 378041 | 194698 | 0.43778194497789624 | 0.6089684830262999 |
| 4 | Necrosis/debris | 0 | 174643 | 0.0 | 0.0 |
| 9 | Fat | 0 | 0 |
本次选择与替换 · 供核对
| 项目 | 采用方案 | 选择依据 | 影响 / 差异 | 用户明确要求 |
|---|---|---|---|---|
| 独立实现与依赖 | 从头实现最小CPU监督模型;仅复用方法与标签语义 | 已绑定数据足以训练;选择当前可导入的隔离环境 | 具体训练与留出范围写入METHODS.md,输出实测指标 | 未限定,由插件选择 |
| 评价定义修正 | 非空并集类别IoU计入;空并集才null | GT为0但有预测的坏死应记IoU/Dice为0 | 新增四类非空并集宏IoU,保留三类GT支持均值;模型与预测逐字节复用 | 未限定,由插件选择 |
待补充事项与解释范围
执行记录未登记待补充项;科研结论仍需结合研究设计核对。
- 描述统计只反映已生成的输出;不自动证明样本独立性、无数据泄漏、模型校准或外部泛化。
- 二分类指标仅在 CSV 提供 0/1 真值与 [0,1] 概率时计算;缺少类别时 AUROC 记为 null。